Ya se sabe quiénes serán los integrantes del grupo de Cruz Azul en la segunda edición del Torneo de Copa, que tendrá novedades. La Copa México tendrá su segunda edición en el primer semestre de 2013 y ya se sabe qué equipos se enfrentarán entre sí durante la Fase de Grupos. La novedad con respecto al certamen de este año es que serán seis los grupos en vez de siete, y que pasarán a cuartos de final los primeros de cada grupo más los dos mejores segundos. La Máquina integrará el Grupo 3, que compartirá con el Atlas, Lobos BUAP e Irapuato. Así quedaron conformados los grupos:
G1: América, Necaxa, Neza y Altamira. G2: Morelia, Querétaro, Estudiantes UAG y Veracruz G3: Cruz Azul, Atlas, Lobos BUAP e Irapuato. G4: Pumas, Puebla, Mérida y Celaya. G5: Jaguares, San Luis, La Piedad y Cruz Azul Hidalgo. G6: Pachuca, Atlante, Dorados y Correcaminos.