Stephen Eustáquio se lesionó a fines de enero de 2019, justo en su debut por Cruz Azul ante Xolos de Tijuana por la jornada 6 del torneo de Clausura 2019 de Liga MX. Se cortó el ligamento cruzado anterior y se hirió los meniscos. El 30 de enero fue operado.

El portugués ya lleva seis meses en recuperación y se espera que su rehabilitación se extendiera por al menos ocho meses, es decir, que regrese a principios de octubre a las canchas.

Cruz Azul publicó su reporte médico semanal y Stephen Eustáquio es el único jugador que permanece lesionado y esperando iniciar la readaptación deportiva y dejar atrás el alta médica.